Klubben hadde først navnet West Gorton Saint Marks, deretter tok de navnet Gordon FC etter å ha fusjonert med Gorton Athletics i 1884. I 1887 flyttet de til en ny fotballbane og tok navnet Ardwick AFC. Ardwick AFC gikk konkurs i 1894, og da klubben begynte på nytt tok de navnet Manchester City.
Plassering 2007/08: Nummer ni i Premier League med 55 poeng på 38 kamper (15–10–13).
Klubben vant sin første tittel på 35 år da de vant FA-cupen i 2011.
Foran sesongen 2011/2012 endret den nye eieren hjemmebanens navn til Etihad Stadium. Klubbens manager Roberto Mancini fikk avskjed i 2013, da det eneste av klubbens mål for sesongen som var oppnådd var at den kvalifiserte seg til UEFA Champions League.[1] I hans siste år endte klubben på andreplass i FA-cupen og i ligaen, og assisterende manager Brian Kidd ble utnevnt til interimmanager for sesongens siste to kamper.
Chileneren Manuel Pellegrini tok over managerstolen etter Mancini. Samme sesong vant City både Ligacupen og Premier League.
Underveis i 15/16 sesongen, ble det klart at Josep "Pep" Guardiola var ansatt som Pellegrinis arvtaker f.o.m 16/17 sesongen.
I sin avskjedssesong tok Pellegrini sitt 3. trofé med klubben, da Liverpool ble slått på straffespark i Ligacupfinalen.