Ilse Aigner (født 7. desember1964 i Feldkirchen-Westerham, Oberbayern) er en tysk politiker (CSU). Hun var mellom 2008 og 2013 Tysklands minister for ernæring, landbruk og forbrukersaker. Hun ble i 2013 utnevnt til minister og stedfortredende ministerpresident i Bayern.
Aigner er utdannet elektroingeniør og har arbeidet i industrien, blant annet med utvikling av elektriske systemer for helikoptre.
Aigner ble i 1983 engasjert i Junge Union og ble i 1985 også med i Christlich-Soziale Union in Bayern. Hun var engasjert i lokalpolitikk og var fra 1994 til 1998 medlem av Landdagen i Bayern.
Hun ble valgt til Forbundsdagen i 1998 og var fra 2008 til 2013 medlem av regjeringen Merkel II.
Aigner ble ved valget i Bayern 2013 medlem av Bayerns landdag og deretter utnevnt til delstatsminister for næringsliv, medier, energi og teknologi, samt stedfortredende ministerpresident i regjeringen Seehofer II.[1][2]
