Lewandowski begynte karrieren i Partyzant Leszno. Som tenåring fikk han prøve seg på forskjellige lag uten at det ble vellykket. I 2005 kom han inn på andrelaget til Legia Warszawa som 17-åring. I 2006/07 sesongen ble han solgt til 3.-divisjonsklubben Znicz Pruszków, der han ble toppscorer i ligaen med 15 mål og var hovedpersonen som førte til at laget rykket opp til 2. divisjon, neste sesong var han toppscorer i 2. divisjon med 21 mål.
Han fikk sin debut hos Lech Poznań i en kvalifikasjonskamp til UEFA-cupen mot FK Khazar Lenkoran fra Aserbajdsjan, han scoret faktisk sitt første mål under debutkampen og ble det eneste målet i kampen (Khazar 0:1 Lech). Hans debut i Orange Ekstraklasa kom 8. august2008.
I november 2013 bekreftet han at han ville signere en kontrakt med Bayern München i januar 2014, slik at han kunne gå vederlagsfritt til Bayern i sommervinduet. 1. juli gjennomførte han overgangen og ble Bayerns nye superspiss. Samtidig brant han mange broer i Dortmund da han valgte å gå til erkerivalen og tittelutfordreren Bayern.
Den 22. september scoret Lewandowski 5 mål på 9 minutter mot VfL Wolfsburg, hvor Bayern München vant 5-1. Han ble toppscorer i Bundesliga i 2015/16-sesongen.
13. desember 2016 skrev han under en ny kontrakt med Bayern München til 30. juni 2021.[4]
