Hopp til innhold

SARS-CoV-2 Zeta-varianten

Fra Wikipedia, den frie encyklopedi

SARS-CoV-2 Zeta-varianten, også kjent som lineage P.2, [a] er en variant av SARS-CoV-2, viruset som forårsaker covid-19. Den ble først oppdaget i den brasilianske delstaten Rio de Janeiro. Den har den genetiske mutasjonen E484K, men ikke N501Y- eller K417T-mutasjoner.

Den utviklet seg i Rio de Janeiro uten å være direkte relatert til Gamma-varianten fra Manaus i Brasils indre.[1][2]

Under Verdens helseorganisasjons (WHO) forenklede system ble P.2 gitt betegnelsen Zeta-varianten, og ble betraktet som variant of interest (VOI), men ikke som en variant of concern.[3] Per juli 2021 ble ikke lenger Zeta betraktet som variant of interest av WHO.[4]

Mutasjoner

[rediger | rediger kilde]

Zeta-genomet har tre aminosyremutasjoner: E484K, D614G og V1176F, alle i virusets spikeprotein.[5] Ifølge Centers for Disease Control and Prevention er F565L blitt funnet i noen Zeta-variantsekvenseringer, men ikke i alle.[6]

  • Aminosyremutasjoner i SARS-CoV-2 Zeta-varianten plottet inn på et genomkart av SARS-CoV-2 med et fokus på piggproteinet.[5]
    Aminosyremutasjoner i SARS-CoV-2 Zeta-varianten plottet inn på et genomkart av SARS-CoV-2 med et fokus på piggproteinet.[5]

Noter

[rediger | rediger kilde]
Type nummerering
  1. ^ En sub-lineage av B.1.1.28

Referanser

[rediger | rediger kilde]
  1. ^ «PANGO lineages Lineage P.2». COV lineages. Arkivert fra originalen 28. april 2021. Besøkt 28. januar 2021. «P.2… Alias of B.1.1.28.2, Brazilian lineage» 
  2. ^ Voloch, Carolina M.; da Silva Francisco, Ronaldo; de Almeida, Luiz G. P.; Cardoso, Cynthia C.; Brustolini, Otavio J.; Gerber, Alexandra L.; Guimarães, Ana Paula de C.; Mariani, Diana; da Costa, Raissa Mirella; Ferreira, Orlando C.; Cavalcanti, Adriana Cony (26. april 2021). «Genomic Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Lineage from Rio de Janeiro, Brazil». Journal of Virology. 95 (10). PMC 8139668 Åpent tilgjengelig. PMID 33649194. doi:10.1128/JVI.00119-21. 
  3. ^ «Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings». Virological (på engelsk). 12. januar 2021. Besøkt 26. juni 2021. 
  4. ^ «Tracking SARS-CoV-2 variants». who.int (på engelsk). World Health Organization. 
  5. ^ a b «Spike Variants: Zeta variant, aka P.2». covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database. 1. juli 2021. Besøkt 5. juli 2021. 
  6. ^ «SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions». CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. Besøkt 5. juli 2021. 
Autoritetsdata
Hentet fra «https://no.wikipedia.org/w/index.php?title=SARS-CoV-2_Zeta-varianten&oldid=23571468»