Coronaviridae

Coronaviridae
	Nomenklatur
	Coronaviridae;
	Klassifikasjon
Gruppe	Virus (urangert)
Rike	Orthornavirae
Rekke	Pisuviricota
Klasse	Pisoniviricetes
Orden	Nidovirales
Underorden	Cornidovirineae

Coronaviridae er en familie av RNA-virus i ordenen Nidovirales. Familien inngår i underordenen Cornidovirineae. Familien deles inn i 2 underfamilier, 5 slekter, 26 underslekter og 46 arter ifølge ICTV.^[1] Ytterligere arter er enten ventende eller tentative.^[2]

Det virale genomet er 26–32 kbp i lengde.

Partiklene er gjerne dekorert med store (~20 nm) kronbladformede overflateprojeksjoner («knopper» eller «pigger»), slik at sfæriske partikler sett gjennom elektronmikroskop danner et bilde som minner om en korona.^[3]^[4]

Inndeling[rediger | rediger kilde]

Taksonomi for familien *Coronaviridae* med arter som er patogeniske til mennesker.

Inndelingen følger Catalogue of Life Checklist versjon 2022-06-23^[5] og International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV).^[1]

Treliste

Virus (urangert takson)
- Riboviria (overrike)
  - Orthornavirae (rike)
    - Pisuviricota (rekke)
      - Pisoniviricetes (klasse)
        Nidovirales (orden)
        Cornidovirineae (underorden)
        Coronaviridae (familie)
        Letovirinae (underfamilie)
        Alphaletovirus
        
        Orthocoronavirinae (underfamilie)
        Alphacoronavirus
        
        Betacoronavirus
        
        Deltacoronavirus
        
        Gammacoronavirus

Koronavirus[rediger | rediger kilde]

Utdypende artikkel: Koronavirus

Koronavirus er det alminnelige navnet på Coronaviridae og Orthocoronavirinae, også kalt Coronavirinae.^[6]^[7] Koronavirus forårsaker sykdom i pattedyr og fugler. I mennesker gir koronavirusene luftveisinfeksjoner, inkludert forkjølelse, som vanligvis er milde, selv om sjeldnere former slik som sars og mers kan være dødelige.^[8]

Referanser[rediger | rediger kilde]

^ ^a ^b International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), Walker, P. J., Siddell, S. G., Lefkowitz, E. J., Mushegian, A. R., Adriaenssens, E. M., Alfenas-Zerbini, P., Davison, A. J., Dempsey, D. M., Dutilh, B. E., García, M. L., Harrach, B., Harrison, R. L., Hendrickson, R. C., Junglen, S., Knowles, N. J., Krupovic, M., Kuhn, J. H., Lambert, A. J., et al. (2021). ICTV Master Species List (MSL). In O. Bánki, Y. Roskov, M. Döring, G. Ower, L. Vandepitte, D. Hobern, D. Remsen, P. Schalk, R. E. DeWalt, M. Keping, J. Miller, T. Orrell, R. Aalbu, R. Adlard, E. M. Adriaenssens, C. Aedo, E. Aescht, N. Akkari, P. Alfenas-Zerbini, et al., Catalogue of Life Checklist (2020.v1). https://doi.org/10.48580/dfp3-37z
^ «The species Severe acute respiratory syndrome related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2» (PDF). Nature Microbiology. 5 (4): 536–44. 2020. PMC 7095448 . PMID 32123347. doi:10.1038/s41564-020-0695-z.
^ King, Andrew M. Q.; Adams, Michael J.; Carstens, Eric B. m. fl.., redaktører. (2012-01-01), «Order - Nidovirales» (på en), Virus Taxonomy (Elsevier): ss. 784–794, ISBN 978-0-12-384684-6, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/B9780123846846000665, besøkt 2020-06-08
^ Bukhari, Khulud; Mulley, Geraldine; Gulyaeva, Anastasia A.; Zhao, Lanying; Shu, Guocheng; Jiang, Jianping; Neuman, Benjamin W. (1. november 2018). «Description and initial characterization of metatranscriptomic nidovirus-like genomes from the proposed new family Abyssoviridae, and from a sister group to the Coronavirinae, the proposed genus Alphaletovirus». Virology. 524: 160–171. PMC 7112036 . PMID 30199753. doi:10.1016/j.virol.2018.08.010.
^ Bánki, O., Roskov, Y., Döring, M., Ower, G., Vandepitte, L., Hobern, D., Remsen, D., Schalk, P., DeWalt, R. E., Keping, M., Miller, J., Orrell, T., Aalbu, R., Adlard, R., Adriaenssens, E. M., Aedo, C., Aescht, E., Akkari, N., Alfenas-Zerbini, P., et al. (2022). Catalogue of Life Checklist (Version 2022-06-23). Catalogue of Life. https://doi.org/10.48580/dfpx
^ «2017.012-015S» (xlsx). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (engelsk). Oktober 2018. Arkivert fra originalen 14. mai 2019. Besøkt 24. januar 2020.
^ «ICTV Taxonomy history: Orthocoronavirinae». International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (engelsk). Besøkt 24. januar 2020.
^ «The 2019–2020 Novel Coronavirus (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2) Pandemic: A Joint American College of Academic International Medicine‑World Academic Council of Emergency Medicine Multidisciplinary COVID‑19 Working Group Consensus Paper». ResearchGate. Besøkt 16. mai 2020.

Eksterne lenker[rediger | rediger kilde]

(en) Coronaviridae – oversikt og omtale av artene i WORMS-databasen
(en) Coronaviridae i Encyclopedia of Life
(en) Coronaviridae i Global Biodiversity Information Facility
(en) Coronaviridae hos NCBI
(en) Kategori:Coronaviridae – bilder, video eller lyd på Wikimedia Commons
Coronaviridae – detaljert informasjon på Wikispecies

[ICTV_(2020.v1)-1] International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), Walker, P. J., Siddell, S. G., Lefkowitz, E. J., Mushegian, A. R., Adriaenssens, E. M., Alfenas-Zerbini, P., Davison, A. J., Dempsey, D. M., Dutilh, B. E., García, M. L., Harrach, B., Harrison, R. L., Hendrickson, R. C., Junglen, S., Knowles, N. J., Krupovic, M., Kuhn, J. H., Lambert, A. J., et al. (2021). ICTV Master Species List (MSL). In O. Bánki, Y. Roskov, M. Döring, G. Ower, L. Vandepitte, D. Hobern, D. Remsen, P. Schalk, R. E. DeWalt, M. Keping, J. Miller, T. Orrell, R. Aalbu, R. Adlard, E. M. Adriaenssens, C. Aedo, E. Aescht, N. Akkari, P. Alfenas-Zerbini, et al., Catalogue of Life Checklist (2020.v1). https://doi.org/10.48580/dfp3-37z

[Consensus2020-2] «The species Severe acute respiratory syndrome related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2» (PDF). Nature Microbiology. 5 (4): 536–44. 2020. PMC 7095448 . PMID 32123347. doi:10.1038/s41564-020-0695-z.

[King_et_al._(2012)-3] King, Andrew M. Q.; Adams, Michael J.; Carstens, Eric B. m. fl.., redaktører. (2012-01-01), «Order - Nidovirales» (på en), Virus Taxonomy (Elsevier): ss. 784–794, ISBN 978-0-12-384684-6, http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/B9780123846846000665, besøkt 2020-06-08

[Bukhari_et_al._(2018)-4] Bukhari, Khulud; Mulley, Geraldine; Gulyaeva, Anastasia A.; Zhao, Lanying; Shu, Guocheng; Jiang, Jianping; Neuman, Benjamin W. (1. november 2018). «Description and initial characterization of metatranscriptomic nidovirus-like genomes from the proposed new family Abyssoviridae, and from a sister group to the Coronavirinae, the proposed genus Alphaletovirus». Virology. 524: 160–171. PMC 7112036 . PMID 30199753. doi:10.1016/j.virol.2018.08.010.

[Bánki_et_al._(2022)-5] Bánki, O., Roskov, Y., Döring, M., Ower, G., Vandepitte, L., Hobern, D., Remsen, D., Schalk, P., DeWalt, R. E., Keping, M., Miller, J., Orrell, T., Aalbu, R., Adlard, R., Adriaenssens, E. M., Aedo, C., Aescht, E., Akkari, N., Alfenas-Zerbini, P., et al. (2022). Catalogue of Life Checklist (Version 2022-06-23). Catalogue of Life. https://doi.org/10.48580/dfpx

[2017.012-015S-6] «2017.012-015S» (xlsx). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (engelsk). Oktober 2018. Arkivert fra originalen 14. mai 2019. Besøkt 24. januar 2020.

[OrthocoronavirinaeICTV-7] «ICTV Taxonomy history: Orthocoronavirinae». International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (engelsk). Besøkt 24. januar 2020.

[ACAIM-WACEM_COVID-19_Consensus_Paper-8] «The 2019–2020 Novel Coronavirus (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2) Pandemic: A Joint American College of Academic International Medicine‑World Academic Council of Emergency Medicine Multidisciplinary COVID‑19 Working Group Consensus Paper». ResearchGate. Besøkt 16. mai 2020.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]