Mal:Infoboks proteinfamilie

Fra Wikipedia, den frie encyklopedi
Hopp til: navigasjon, søk
Infoboks proteinfamilie
Identifikatorer
Symbol ?
Dokumentasjonsikon Maldokumentasjon [vis] [rediger] [historikk] [oppdater]

Formål[rediger kilde]

Dette er en mal for proteinfamilie/område som definert i biologiske databaser som Pfam.

Bruk[rediger kilde]

For å bruke denne malen, kopier teksten under og lim den inn på toppen av din artikkel. Fyll ut så mange felt som mulig, men ikke bry deg om noe informasjon mangler.

{{Infoboks proteinfamilie
| Symbol = 
| Name = 
| image = 
| width = 
| caption = 
| Pfam = 
| Pfam_clan = 
| InterPro = 
| SMART = 
| PROSITE = 
| MEROPS =
| SCOP = 
| TCDB = 
| OPM family = 
| OPM protein = 
| CAZy = 
| CDD =
}}

Eksempler[rediger kilde]

Den følgende infoboksen har fylt inn Pfam og skaper boksen til høyre.

Ligand-binding domain (LBD)
Ligand-binding domain (LBD)
Identifikatorer
Symbol Hormone_recep
Pfam PF00104
InterPro IPR000536
SMART SM00430
SCOP 1lbd
SUPERFAMILY 1lbd
CDD cd06157
Infoboks proteinfamilie
Tilgjenglige proteinstrukturer:
Pfam structures
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum structure summary
{{Infoboks proteinfamilie
| Symbol = Hormone_recep
| Name = Ligand-binding domain (LBD)
| image = RORC_3L0L.png
| width = 
| caption = [[RAR-related orphan receptor gamma|RORγ]]
| Pfam = PF00104
| InterPro = IPR000536
| SMART = SM00430
| PROSITE = 
| SCOP = 1lbd
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CDD = cd06157
}}

TemplateData[rediger kilde]

Dette er TemplateData-dokumentasjonen for malen, som brukes av VisualEditor og andre verktøy.

Infoboks proteinfamilie

This is template for a protein family/domain as defined in biological databases such as Pfam.

Malparametre

Parameter Beskrivelse Type Status
Symbol Symbol
Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinje valgfri
Name Name
Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinje valgfri
Image image
Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
Side valgfri
Width width

Width for image

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
Streng valgfri
Caption caption

Caption for image

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
Streng valgfri
Pfam family identifier Pfam

Auto-links to Pfam family record

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinje valgfri
Pfam clan identifier Pfam_clan

Auto-links to Pfam clan record; a clan is a group of related families.

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinje valgfri
Interpro identifier Interpro

Auto-links to an Interpro entry

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinje valgfri
SMART accession number SMART

Auto-links to a domain entry in the Simple Modular Architecture Research Tool

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinje valgfri
PROSITE record identifier PROSITE

Auto-links to a PROSITE record search

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinje valgfri
MEROPS record identifier MEROPS

Auto-links to a MEROPS record (MEROPS is scoped to peptidases and their inhibitors)

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinje valgfri
SCOP (PDB accession number) SCOP

Given a PDB accession number, auto-links to a SCOP (Structural Classification of Proteins) family level page. Also generates an auto-link to a SCOP SUPERFAMILY record.

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinje valgfri
TCDB identifier TCDB

Auto-links to an identifier search in the Transporter Classification Database

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinje valgfri
OPM superfamily identifier OPM family

Auto-links to a superfamily record in the database of Orientations of Proteins in Membranes.

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinje valgfri
OPM protein identifier OPM protein

Value will typically be a PDB identifier; auto-links to a protein record in the database of Orientations of Proteins in Membranes

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinje valgfri
CAZy family identifier CAZy

Auto-links to a family description page in the database of Carbohydrate-Active enZYmes.

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinje valgfri
CDD uid CDD

Auto-links to a record in the Conserved Domain Database

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinje valgfri

Se også[rediger kilde]