Mal:Infoboks proteinfamilie

Fra Wikipedia, den frie encyklopedi
Hopp til: navigasjon, søk
Infoboks proteinfamilie
Identifikatorer
Symbol?
Dokumentasjonsikon Maldokumentasjon [vis] [rediger] [historikk] [oppdater]

Formål[rediger kilde]

Dette er en mal for proteinfamilie/område som definert i biologiske databaser som Pfam.

Bruk[rediger kilde]

For å bruke denne malen, kopier teksten under og lim den inn på toppen av din artikkel. Fyll ut så mange felt som mulig, men ikke bry deg om noe informasjon mangler.

{{Infoboks proteinfamilie
| Symbol = 
| Name = 
| image = 
| width = 
| caption = 
| Pfam = 
| Pfam_clan = 
| InterPro = 
| SMART = 
| PROSITE = 
| MEROPS =
| SCOP = 
| TCDB = 
| OPM family = 
| OPM protein = 
| CAZy = 
| CDD =
}}

Eksempler[rediger kilde]

Den følgende infoboksen har fylt inn Pfam og skaper boksen til høyre.

Ligand-binding domain (LBD)
Ligand-binding domain (LBD)
Identifikatorer
SymbolHormone_recep
PfamPF00104
InterProIPR000536
SMARTSM00430
SCOP1lbd
SUPERFAMILY1lbd
CDDcd06157
Infoboks proteinfamilie
Tilgjenglige proteinstrukturer:
Pfamstructures
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary
{{Infoboks proteinfamilie
| Symbol = Hormone_recep
| Name = Ligand-binding domain (LBD)
| image = RORC_3L0L.png
| width = 
| caption = [[RAR-related orphan receptor gamma|RORγ]]
| Pfam = PF00104
| InterPro = IPR000536
| SMART = SM00430
| PROSITE = 
| SCOP = 1lbd
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CDD = cd06157
}}

TemplateData[rediger kilde]

Dette er TemplateData-dokumentasjonen for malen, som brukes av VisualEditor og andre verktøy.

Infoboks proteinfamilie

This is template for a protein family/domain as defined in biological databases such as Pfam.

Malparametre

ParameterBeskrivelseTypeStatus
SymbolSymbol

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinjevalgfri
NameName

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinjevalgfri
Imageimage

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
Sidevalgfri
Widthwidth

Width for image

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
Strengvalgfri
Captioncaption

Caption for image

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
Strengvalgfri
Pfam family identifierPfam

Auto-links to Pfam family record

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinjevalgfri
Pfam clan identifierPfam_clan

Auto-links to Pfam clan record; a clan is a group of related families.

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinjevalgfri
Interpro identifierInterpro

Auto-links to an Interpro entry

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinjevalgfri
SMART accession numberSMART

Auto-links to a domain entry in the Simple Modular Architecture Research Tool

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinjevalgfri
PROSITE record identifierPROSITE

Auto-links to a PROSITE record search

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinjevalgfri
MEROPS record identifierMEROPS

Auto-links to a MEROPS record (MEROPS is scoped to peptidases and their inhibitors)

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinjevalgfri
SCOP (PDB accession number)SCOP

Given a PDB accession number, auto-links to a SCOP (Structural Classification of Proteins) family level page. Also generates an auto-link to a SCOP SUPERFAMILY record.

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinjevalgfri
TCDB identifierTCDB

Auto-links to an identifier search in the Transporter Classification Database

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinjevalgfri
OPM superfamily identifierOPM family

Auto-links to a superfamily record in the database of Orientations of Proteins in Membranes.

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinjevalgfri
OPM protein identifierOPM protein

Value will typically be a PDB identifier; auto-links to a protein record in the database of Orientations of Proteins in Membranes

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinjevalgfri
CAZy family identifierCAZy

Auto-links to a family description page in the database of Carbohydrate-Active enZYmes.

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinjevalgfri
CDD uidCDD

Auto-links to a record in the Conserved Domain Database

Standard
Eksempel
tom
Autoverdi
tom
tekstlinjevalgfri

Se også[rediger kilde]