SARS-CoV-2 Delta-varianten: Forskjell mellom sideversjoner
Ny side: '''Lineage B.1.617''', også kjent som '''VUI (Variant Under Investigation)-21APR-01''',<ref>{{cite web |title=Variants: distribution of cases data |url=https://www.gov.uk/government/pub… Tagg: Innsetting av nowiki-tagger i hovednavnerommet |
(Ingen forskjell)
|
Sideversjonen fra 28. apr. 2021 kl. 08:46
Lineage B.1.617, også kjent som VUI (Variant Under Investigation)-21APR-01,[1] er en av de kjente variants of SARS-CoV-2, det virus som forårsaker covid-19.[2] Den ble først identifisert i India den 5. oktober 2020[3] og er en «dobbelmutasjonvariant».[4][5][6]
Med «dobbel mutasjon» siktes det til B.1.617s mutasjoner i SARS-CoV-2s spikeproteins[7] kodesekvens i posisjonene 484 og 452 - E484Q og L452R.[8] Den terminologien er omstridt. Kristian Andersen, forsker innen smittsomme sykdommer, sa til radiostasjonen NPR at «SARS-CoV-2 muterer hele tiden. Det er en mengde dobbeltmutasjoner overalt. Varianten i India burde ikke omtales slik.»[9]
Mutasjoner
B.1.617-genomet har 13 mutasjoner som utgjør endringer av dets koding.[10] Det er tre av dem, samtlige i virusets spikeproteinkode, er særlig bekymringsfulle:
- E484Q. Denne mutasjonen i posisjon 484, en glutamic acid-til-glutamine-substitution, gir B.1.617-varianten et sterkerer bindingpotensial til hACE2 (den humane ACE2-reseptoren), og dessuten en større evne til å unngå immunsystemet det står overfor enn det andre varianter har.[8]
- L452R. Denne mutasjonen i posisjon 452, en leucine-til-arginine-substitusjon, gir en sterkere affinitet i spikeproteinet for ACE2-reseptoren og immunsystemets evne til å oppdage viruset svekkes.[8][11]
Disse mutasjonene er hver for seg ikke unike for varianten; det er at de er tilstede samtidig som er det unike.[8][5]
- P681R. Denne mutasjonen i posisjon 681, en proline-til-arginine-substitusjon, kan, i følge William A. Haseltine, øke smittespredende evne på cellenivå (boost cell-level infectivity).[12]
Karakteristika
Pågående forskning tyder på at varianten er lettere overførbar - mer smittsom - enn tidligere varianter.[13] Hvorvidt dette betyr noe for de vaksiner som er i bruk (april 2021) er gjenstand for utredning.[14][15]Mal:Better source needed
Tall fra den indiske regjerings Integrated Disease Surveillance Programme (IDSP) viser at rundt 32% av pasienter, både på sykehus og utenfor sykehus, var under 30 i den indiske andre bølge, sammenlignet med 31% under første bølge. I aldersgruppen 30-40 steg 20-39-spennet til 25,5% fra 23,7% tidligere. Tallene påviste også en høyere andel asymptomatiske pasienter som ble innlagt på sykehus, slike som kun hadde stterke pustesbesvær.[16]
Vaksineeffentivitet
ICMR fant at convalescent serum hos covid-19-rammede og mottagere av Bharat Biotechs BBV152-vaksine (Covaxin) var i stand til å nøytralisere VUI B.1.617, men med en svakere effekt.[17]
Anurag Agrawal, direktør for Director of the Institute of Genomics and Integrative Biology (IGIB), sa at analyser av de anvendte vaksiner i forhold til B.1.617-varianten avf SARS-CoV2 at infeksjonerne etter vaksinering var mildere. «Initial positive neutralisation studies of B.1.617, with both post-Covaxin or Covishield sera, are correlatable with milder disease during post-vaccination breakthrough infections. This is a positive while we get quantitative data for better understanding of infection protection,» skrev Agrawal i en tweet 27. april.[18]
Per 27. aoril 2021 var larianten blitt funnet i 20 land, om enn i mange i enktelttilfelle eller då tilfeller.
Se også
Referanser
- ^ «Variants: distribution of cases data». GOV.UK (engelsk). Public Health England. Mal:OGL-attribution
- ^ «Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK». 15. april 2021.
- ^ «Expert reaction to cases of variant B.1.617 (the ‘Indian variant’) being investigated in the UK». Science Media Centre. Science Media Centre. Besøkt 20 April 2021. Sjekk datoverdier i
|besøksdato=(hjelp) - ^ «PANGO lineages Lineage B.1.617». cov-lineages.org. Besøkt 19. april 2021.
- ^ a b Koshy, Jacob (8. april 2021). «Coronavirus | Indian 'double mutant' strain named B.1.617». The Hindu (engelsk). «Though these mutations have individually been found in several other coronavirus variants, the presence of both these mutations together have been first found in some coronavirus genomes from India.»
- ^ Cuff, Madeleine (19 April 2021). «Indian variant: Cases of new 'double mutation' Covid strain thought to be spreading in UK». i. London. Sjekk datoverdier i
|dato=(hjelp) - ^ Shang, Jian; Yushun, Wan; Lou, Chuming; Ye, Gang; Geng, Qibin; Auerbach, Ashley; Fang, Li (2020). «Cell entry mechanisms of SARS-CoV-2». Proceedings of the National Academy of Sciences. 117 (21): 11727–11734. doi:10.1073/pnas.2003138117.
- ^ a b c d Starr, Tyler N.; Greaney, Allison J.; Dingens, Adam S.; Bloom, Jesse D. (April 2021). «Complete map of SARS-CoV-2 RBD mutations that escape the monoclonal antibody LY-CoV555 and its cocktail with LY-CoV016». Cell Reports Medicine: 100255. doi:10.1016/j.xcrm.2021.100255.
- ^ «People Are Talking About A 'Double Mutant' Variant In India. What Does That Mean?». NPR.org (engelsk).
- ^ «Expert reaction to cases of variant B.1.617 (the ‘Indian variant’) being investigated in the UK | Science Media Centre». Science Media Centre. Besøkt 26. april 2021.
- ^ Zhang, Wenjuan; Davis, Brian D.; Chen, Stephanie S.; Sincuir Martinez, Jorge M.; Plummer, Jasmine T.; Vail, Eric (6. april 2021). «Emergence of a Novel SARS-CoV-2 Variant in Southern California». JAMA. 325 (13): 1324. doi:10.1001/jama.2021.1612.
- ^ Haseltine, William. «An Indian SARS-CoV-2 Variant Lands In California. More Danger Ahead?». Forbes (engelsk). - «by facilitating cleavage of the S precursor protein to the active S1/S2 configuration»
- ^ Deng, Xianding; Garcia-Knight, Miguel A.; Khalid, Mir M.; Servellita, Venice; Wang, Candace; Morris, Mary Kate; Sotomayor-González, Alicia; Glasner, Dustin R.; Reyes, Kevin R.; Gliwa, Amelia S.; Reddy, Nikitha P.; Martin, Claudia Sanchez San; Federman, Scot; Cheng, Jing; Balcerek, Joanna; Taylor, Jordan; Streithorst, Jessica A.; Miller, Steve; Sreekumar, Bharath; Chen, Pei-Yi; Schulze-Gahmen, Ursula; Taha, Taha Y.; Hayashi, Jennifer; Simoneau, Camille R.; Kumar, G. Renuka; McMahon, Sarah; Lidsky, Peter V.; Xiao, Yinghong; Hemarajata, Peera; Green, Nicole M. (20. april 2021). «Transmission, infectivity, and neutralization of a spike L452R SARS-CoV-2 variant». Cell. 0 (0). doi:10.1016/j.cell.2021.04.025.
- ^ «Twitter». Twitter (engelsk).
- ^ «Twitter». Twitter (engelsk).
- ^ Dey, Sushmi. «Covid second wave in India: Percentage of young infected in second wave same, but more serious». The Times of India (engelsk).
- ^ Yadav, Pragya D; Sapkal, Gajanan N. «Neutralization of variant under investigation B.1.617 with sera of BBV152 vaccinees» (PDF). doi:10.1101/2021.04.23.441101. Besøkt 24 April 2021. Sjekk datoverdier i
|besøksdato=(hjelp) - ^ «Covishield Covaxin effective against 'Indian strain' of coronavirus study suggests». The Week (engelsk). Besøkt 27. april 2021.