SARS-CoV-2 Alfa-varianten: Forskjell mellom sideversjoner

Fra Wikipedia, den frie encyklopedi
Neste endring →
Slettet innhold Innhold lagt til
VisuellWikitekst
Ctande (diskusjon | bidrag)
Patruljører
582 816 redigeringer
Ny side: '''Variant of Concern 202012/01 (VOC-202012/01)''', <ref>{{Webbref|titel=Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/scientific-brief-emerging-…
(Ingen forskjell)

Sideversjonen fra 5. jan. 2021 kl. 01:45

Variant of Concern 202012/01 (VOC-202012/01), [1][2]også kalt B.1.1.7,[3][4] er en variant av SARS-CoV-2, viruset som fører til Covid-19. Varianten ble først oppdaget i Storbritannia i oktober 2020 fra en sekvensert virusprøve fra september,[5] og begynte å spre seg bredt i midten av desember. Varianten syntes også å korrelere med den betydelige økningen av bekreftede sykdomstilfeller i England. Denne økningen antas delviså skyldes at mutasjonen av N501Y inne i lipidhöljets proteiners reseptor-bindende domän som trenges for å bindes til ACE2 hos menneskets celler.

Nomenklatur

Varianten ble kalt B.1.1.7,[6] og Variant of Concern 202012/01 (VOC-202012/01).[7] Varianten var tidligere også kalts for the first Variant Under Investigation in December 2020 (VUI – 202012/01) av Public Health England,[8] men navnet ble senere endret til Variant of Concern (VOC-202012/01) den 21. desember 2020. Tidlige rapporter kalte varianten UK COVID-19 variant,[9][10][11] och UK Coronavirus variant.[12][13]

Oppdagelse

VOC-202012/01 ble oppdahet i oktober 2020 av COG-UK (COVID-19 Genomics UK) som er en koalisjon bestående av myndigheter og NHS.[14] Varianten ble oppdsget i en virusprøve som var blitt sekvensert i september samme år.[15] Varianten spredte seg uten kontroll i det sørlige England. Flere land i Europa og i Australia oppdaget man varianten.[16] Flere europeiske land svarte med å forby inreise fra Storbritannia for å stagge spredningen av varianten.[17]

De to første genoppsetningene tilhørende B.1.1.7-stammen ble innsamlet 20. september 2020 i Kent i England og ytterligere ett den 21. september 2020 i London.[18] I løpet av de første to uker fra 15. desember ble det foretatt 1623 genuppsetninger i B.1.1.7-stammen. Av disse kom 519 prøver inn fra London, 555 fra Kent, 545 fra andra regioner i Storbritannia og ytterligere 4 fra andre land.[19]

Smittesporing påviste at denne variant framtrådte i september 2020 og sirkulerte i lave nivåer i midten av november. Førsea gang denne variant kunne koblrs til økningen av tilfeller var sent av november da Public Health England (PHE) utredet hvorfor smitten ikke sank i Kent trass i nasjonalle restriksjoner. PHE oppdaget så en klynge (cluster) som kunne knyttes til denna varianten som spredtes raskt til London og Essex.[20]

Skjønt varianten først ble oppdaget i Kent er det ikke fastlagt hvor den har sitt oppphav. Teorier spekulerer at varianten kan ha opphav hos en kronisk syk person med nedsatt immunforsvar som kan ha gitt viruset lang tid til å forøke seg og muterw.[21][22]

Karakter

Genetikk

En mutasjon av SARS-CoV-2 er vanlig forekommande: nærmere 4000 mutasjoner er blitt påvist i virusets spike glykoprotein, i gølge COG-UK.[23] Fokus på mutasjoner er en vanlig måte å spore spredningen av viruset. Det viser også tt SARS-CoV-2 kom til Storbritannia i over 1000 enkelttilfeller og det viser at en variant med mutasjon G614 har helt fortrengt den tidligere mutasjonen D614.[24]

VOC-202012/01-varianten karakteriseres av 23 mutasjoner: 13 ikke-synonyma mutasjoner, 4 deletions og 6 synonymr mutadjoner.[2] Det er 17 mutasjoner som endrer proteinet og seks som ikke gjør det.[25]

Effekt på vaksine

I 2020 fremsted flere kandidater til Covid-19-vaksiner som ble utforsket eller levert til land, blant annet Pfizer-BioNTechs kandidat.

Siden 20. desember 2020 var bildet fra Public Health England at det ikke var beviser som skulle gi mistanker om at mutasjonen skulle være immun mot Pfizer-BioNTechs vaksine som favar blitt introdusert i Storbritannias vaksineprogram. Opfatningen er at mennesker fortsatt turde bli beskyttet mot Covid-19 med vaksinen.[26]

Spredning

Det første tilfalle var troligt i midten av september 2020 i London eller Kent i Storbritannia.[27] Fra og med 13. desember 2020 til årsskiftet var det identifisert 1108 smittetilfeller med denne varianten i Storbritannia hos nærmere 60 lokalmyndigheter. Majoriteten var i sørøstre England. Denne varianten ble også funnet i Wales og Skottland.[28] I midten av desember ble det beregnet at nesten 60% av alle tilfeller i London var med varianten VOC-202012/01.[29] Den 20. desember rapportertreBBC at WHO meldte om ni nye tilfeller oppdaget i Danmark og et hver i både Nederland og Australia.[30][31] Senare samme dag tilkom det fire nye tilfeller i Belgia,[32] og ett i Italia.[33] Storbritannien och Danmark sekvenserar sina smittprover i mycket högre grad än andra länder[34] og derfor var det plausibelt at flere land ville oppdage varianten før eller siden.[35]

En stamne med samme N501Y-mutasjon (som kan gi mege mer smittespredning), men med annen opprinnelse enn det i Storbritannia ble også funnet i Sørafrika.[36] N501Y-mutasjonen ble oppdagetogså i Australia i juni-juli, i USA i juli og i Brasil i april. Det er heller ikke klart om den var fremvokst i Storbritannia eller var en import dit.[37]

Referanser

  1. ^ CDC (11. februar 2020). «Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)». Centers for Disease Control and Prevention (engelsk). Besøkt 23. desember 2020. 
  2. ^ a b «Investigation of novel SARS-COV-2 variant - Variant of Concern 202012/01» (PDF). Public Health England. 22. desember 2020. Besøkt 23. desember 2020. 
  3. ^ «Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations». Virological (engelsk). 18. desember 2020. Besøkt 21. desember 2020. 
  4. ^ KupferschmidtDec. 20, Kai (20. desember 2020). «Mutant coronavirus in the United Kingdom sets off alarms, but its importance remains unclear». Science | AAAS (engelsk). Besøkt 21. desember 2020. 
  5. ^ «Covid: Nations impose UK travel bans over new variant». BBC News (engelsk). 20. desember 2020. Besøkt 21. desember 2020. 
  6. ^ Rambaut, Andrew; Loman, Nick; Pybus, Oliver; Barclay, Wendy; Barrett, Jeff; Carabelli, Alesandro; Connor, Tom; Peacock, Tom; L. Robertson, David; Vol, Erik. «Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations». Written on behalf of COVID-19 Genomics Consortium UK. Besøkt 4. januar 2021. 
  7. ^ Chand, Meera; Hopkins, Susan; Dabrera, Gavin; Achison, Christina; Barclay, Wendy; Ferguson, Neil; Volz, Erik; Loman, Nick; Rambaut, Andrew; Barrett, Jeff (21. desember 2020). «Investigation of novel SARS-COV-2 variant: Variant of Concern 202012/01» (PDF). Public Health England. Besøkt 4. januar 2021. 
  8. ^ «PHE investigating a novel variant of COVID-19». GOV.UK (engelsk). Besøkt 4. januar 2021. 
  9. ^ «More Contagious Variant Of COVID-19 Reaches Florida – NBC 6 South Florida». web.archive.org. 2. januar 2021. Besøkt 4. januar 2021. 
  10. ^ News, A. B. C. «UK COVID-19 variant detected in US: What we know about the Colorado cases». ABC News (engelsk). Besøkt 4. januar 2021. 
  11. ^ «Coronavirus: What's happening in Canada and around the world on Sunday | CBC News». CBC (engelsk). Besøkt 4. januar 2021. 
  12. ^ Forster, Victoria. «Study Confirms New U.K. Coronavirus Variant Is Substantially More Transmissible». Forbes (engelsk). Besøkt 4. januar 2021. 
  13. ^ Kelland, Kate (21. desember 2020). «UK coronavirus variant may be more able to infect children: scientists». Reuters (engelsk). Besøkt 4. januar 2021. 
  14. ^ «Who We Are - COG-UK Consortium». www.cogconsortium.uk (engelsk). Besøkt 23. desember 2020. 
  15. ^ «Covid: Nations impose UK travel bans over new variant». BBC News (engelsk). 20. desember 2020. Besøkt 21. desember 2020. 
  16. ^ Welle (www.dw.com), Deutsche. «COVID-19: More countries detect mutated UK coronavirus strain | DW | 21.12.2020». DW.COM (engelsk). Besøkt 21. desember 2020. 
  17. ^ Syal, Rajeev; Grover, Natalie; Jones, Sam (20. desember 2020). «European states ban travel from UK as new Covid strain takes hold». The Guardian (engelsk). ISSN 0261-3077. Besøkt 21. desember 2020. 
  18. ^ «Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations». Virological (engelsk). 18. desember 2020. Besøkt 22. desember 2020. 
  19. ^ «Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations». Virological (engelsk). 18. desember 2020. Besøkt 22. desember 2020. 
  20. ^ «COVID-19 (SARS-CoV-2): information about the new virus variant». GOV.UK (engelsk). Besøkt 22. desember 2020. 
  21. ^ «New coronavirus variant: What do we know?». BBC News (engelsk). 20. desember 2020. Besøkt 23. desember 2020. 
  22. ^ «Here's what we know about the new variant of coronavirus | Sharon Peacock». the Guardian (engelsk). 22. desember 2020. Besøkt 23. desember 2020. 
  23. ^ Mal:Tidskriftsref
  24. ^ Mal:Tidskriftsref
  25. ^ «Here's what we know about the new variant of coronavirus | Sharon Peacock». the Guardian (engelsk). 22. desember 2020. Besøkt 23. desember 2020. 
  26. ^ «COVID-19 (SARS-CoV-2): information about the new virus variant». GOV.UK (engelsk). Besøkt 1. januar 2021. 
  27. ^ Higgins-Dunn, Noah (19. desember 2020). «The U.K. has identified a new Covid-19 strain that spreads more quickly. Here's what they know». CNBC (engelsk). Besøkt 22. desember 2020. 
  28. ^ «COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium - Wellcome Sanger Institute». www.sanger.ac.uk (engelsk). Besøkt 22. desember 2020. 
  29. ^ «London Begins Emergency Lockdown as U.K. Fights New Virus Strain». Bloomberg.com (engelsk). 19. desember 2020. Besøkt 22. desember 2020. 
  30. ^ «Covid: WHO in 'close contact' with UK over new virus variant». BBC News (engelsk). 20. desember 2020. Besøkt 22. desember 2020. 
  31. ^ Henley, Jon; Jones, Sam; Giuffrida, Angela (20. desember 2020). «EU to hold crisis talks as countries block travel from UK over new Covid strain». The Guardian (engelsk). ISSN 0261-3077. Besøkt 22. desember 2020. 
  32. ^ «Netherlands bans flights from UK over new Covid mutation». The Brussels Times (engelsk). 20. desember 2020. Besøkt 22. desember 2020. 
  33. ^ «Coronavirus, una donna italiana positiva alla variante inglese: è in isolamento e ha una forte carica virale». la Repubblica (italiensk). 20. desember 2020. Besøkt 22. desember 2020. 
  34. ^ «Dansk Oxford-professor: Danmark skal gøre alt for, at ny virusvariant ikke spreder sig». DR (dansk). 20. desember 2020. Besøkt 22. desember 2020. 
  35. ^ Kwai, Isabella; Mandavilli, Apoorva; Stevis-Gridneff, Matina (20. desember 2020). «More Countries Impose U.K. Travel Restrictions as Concerns Mount Over Virus Mutation». The New York Times (engelsk). ISSN 0362-4331. Besøkt 22. desember 2020. 
  36. ^ «South Africa facing isolation amid fears over new COVID strain». www.aljazeera.com (engelsk). Besøkt 22. desember 2020. 
  37. ^ «expert reaction new restrictions and the new SARS-CoV-2 variant | Science Media Centre» (engelsk). Besøkt 22. desember 2020. 
Hentet fra «https://no.wikipedia.org/w/index.php?title=SARS-CoV-2_Alfa-varianten&oldid=21051562»