SARS-CoV-2 Kappa-varianten: Forskjell mellom sideversjoner

Fra Wikipedia, den frie encyklopedi
Slettet innhold Innhold lagt til
Ctande (diskusjon | bidrag)
Ny side: '''SARS-CoV-2 Kappa-varianten'''<ref name=WHO1>{{Cite web|title=Tracking SARS-CoV-2 variants|url=https://www.who.int/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants|access-date=2021-06-05|websit…
(Ingen forskjell)

Sideversjonen fra 9. jun. 2021 kl. 15:46

SARS-CoV-2 Kappa-varianten[1] er en sublineære variant av SARS-CoV-2, det virus som forårsaker covid-19. Den er en av tre versjoner av Lineage B.1.617 som også kjent som Delta-varianten.

=Beskrivelse

SARS-CoV-2 Kappa-varianten er også kjent som Lineage B.1.617.1 of var først oppdaget i India i desember 2020.[2] Mot slutten av mars 2021 stod Kappa-subvarianten for mer enn halve sekvensene som bler innrapportert fra India.[3] Den 1. april 2021 ble den designert Variant Under Investigation (VUI-21APR-01) av Public Health England.[4]

Mutasjoner=

Kappa-varianten har tre betydningsfulle endreinger i aminosyresekvensene, som alle gjelder virusets piggprotein<noweiki><(nowiki>kode.

Disse er substitudjonene L452R, E484Q og P681R[5]

  • L452R. The substitution at position 452, a leucine-to-arginine substitution. This exchange confers stronger affinity of the spike protein for the ACE2 receptor along with decreased recognition capability of the immune system.[6][7]
  • E484Q. The substitution at position 484, a glutamic acid-to-glutamine substitution. This alteration confers the variant stronger binding potential to Angiotensin-converting enzyme 2, as well as better ability to evade hosts' immune systems.[8][9]
  • P681R. The substitution at position 681, a proline-to-arginine substitution.[10][8]

European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC) oppfører også en fjerde piggmutasjon av interesse:[11]

  • D614G. The substitution at position 614, an aspartic acid-to-glycine substitution.[12] Variants which have the D614G mutation are associated with increased infectivity.[13][14]

Referanser

  1. ^ «Tracking SARS-CoV-2 variants». www.who.int (engelsk). 31. mai 2021. Besøkt 5. juni 2021. 
  2. ^ «Weekly epidemiological update on COVID-19 - 27. april 2021» (PDF). World Health Organization. 27. april 2021. Besøkt 6. juni 2021. 
  3. ^ Le Page, Michael (4. juni 2021). «Indian covid-19 variant (B.1.617)». New Scientist. 
  4. ^ Mal:Cite report Mal:OGL-attribution
  5. ^ Nuki, Paul; Newey, Sarah (16. april 2021). «Arrival of India's 'double mutation' adds to variant woes, but threat posed remains unclear». The Telegraph (engelsk). ISSN 0307-1235. 
  6. ^ Starr, Tyler N.; Greaney, Allison J.; Dingens, Adam S.; Bloom, Jesse D. (April 2021). «Complete map of SARS-CoV-2 RBD mutations that escape the monoclonal antibody LY-CoV555 and its cocktail with LY-CoV016». Cell Reports Medicine. 2 (4): 100255. PMC 8020059Åpent tilgjengelig. PMID 33842902. doi:10.1016/j.xcrm.2021.100255. 
  7. ^ Zhang, Wenjuan; Davis, Brian D.; Chen, Stephanie S.; Sincuir Martinez, Jorge M.; Plummer, Jasmine T.; Vail, Eric (6 April 2021). «Emergence of a Novel SARS-CoV-2 Variant in Southern California». JAMA. 325 (13): 1324–1326. PMC 7879386Åpent tilgjengelig. PMID 33571356. doi:10.1001/jama.2021.1612.  Sjekk datoverdier i |dato= (hjelp)
  8. ^ a b Haseltine, William. «An Indian SARS-CoV-2 Variant Lands In California. More Danger Ahead?». Forbes (engelsk). 
  9. ^ Harvey, WT; Carabelli, AM; Jackson, B; Gupta, RK; Thomson, EC; Harrison, EM; Ludden, C; Reeve, R; Rambaut, A; Peacock, SJ; Robertson, DL. «SARS-CoV-2 variants, spike mutations and immune escape». Nat Rev Microbiol. PMC 8167834Åpent tilgjengelig. PMID 34075212. doi:10.1038/s41579-021-00573-0. «For example, recently detected viruses of lineage B.1.617.1 were anticipated to show altered antigenicity due to the presence of the substitutions L452R and E484Q, which have been described as affecting antibody recognition.» 
  10. ^ «SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions». cdc.org. Centers for Disease Control and Prevention. Besøkt 7. juni 2021. 
  11. ^ «SARS-CoV-2 variants of concern as of 3 June 2021». European Centre for Disease Prevention and Control. 3 June 2021. Besøkt 8. juni 2021.  Sjekk datoverdier i |dato= (hjelp)
  12. ^ Dr. Sanchari Sinha Dutta, Ph.D (15 March 2021). «D614G Mutation in SARS-CoV-2 Spike Protein». News Medical.  Sjekk datoverdier i |dato= (hjelp)
  13. ^ Korber, Bette; Fischer, Will M.; Gnanakaran, Sandrasegaram; Yoon, Hyejin; Theiler, James; Abfalterer, Werner; Hengartner, Nick; Giorgi, Elena E.; Bhattacharya, Tanmoy; Foley, Brian; Hastie, Kathryn M.; Parker, Matthew D.; Partridge, David G.; Evans, Cariad M.; Freeman, Timothy M.; de Silva, Thushan I.; McDanal, Charlene; Perez, Lautaro G.; Tang, Haili; Moon-Walker, Alex; Whelan, Sean P.; LaBranche, Celia C.; Saphire, Erica O.; Montefiori, David C. (20 August 2020). «Tracking Changes in SARS-CoV-2 Spike: Evidence that D614G Increases Infectivity of the COVID-19 Virus». Cell. 182 (4): 812-827. doi:10.1016/j.cell.2020.06.043.  Sjekk datoverdier i |dato= (hjelp)
  14. ^ «SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions». cdc.gov. 4 June 2021. Besøkt 8. juni 2021. «These variants share one specific mutation called D614G... ...There is evidence that variants with this mutation spread more quickly than viruses without this mutation.»  Sjekk datoverdier i |dato= (hjelp)

Mal:COVID-19 pandemic