Av de tilsammen 43 lagene som kjempet om seieren, var bare syv forhåndskvalifisrt. Fem av de syv var forutsigbare; FFC Frankfurt, som vant Bundesliga, Turbine Potsdam (tittelforsvarer), Djurgården/Älvsjö, Arsenal og Brøndby. Mer overraskende var det at Gömrükçü Baku fra Aserbajdsjan og ZFK Masinac Classic Niš fra Serbia og Montenegro.
I gruppe 1 var Montpellier HSC store favoritter. På tross av at de bare var med for andre gang, var de på papiret det klart sterkeste laget. De to britiske lagene som stilte, kom fra ligaer i nedre del av UEFAs rangering, og det var bare SU 1° Dezembro som kunne bidra med motstand. Dezembro og Montpeillier møtte hverandre også forrige kvalifiseringsrunde, da Dezembro fikk til et hederlig 0-1-tap mot Montpellier, som ble gruppevinner i kvalifiseringsrunden, men endte sist i gruppespillet deretter. Dezembro gjentok det hederlige tapet, noe som førte til at Montpellier gikk videre.
En av de store bombene kom i gruppe 2, der forhåndsfavorit Bardolino hadde kvalifisert seg på bekostning av Torres, som året før hadde kommet til kvartfinalen og spilt jevnt mot topplaget Arsenal LFC. Bardolino var derfor favoritt, men SV Neulengbach ville det annerledes, og kvalifiserte seg på målforskjell etter å ha greid en målløs uavgjort mot Bardolino i siste kamp.
Denne gruppen var noe jevnere enn de andre, da både SV Sastum og Athletic Club Neskak var gode nok. Gruppen ble også veldig jevn, og Saestum trakk det lengste strået med ett mindre insluppet mål enn Neskak.
I gruppe 4 kom også en skrell da Valur slo favoritten Røa allerede i første kamp, og det klart. Deretter trygget Valur gruppeseieren i land og kom videre til andre gruppespill.
Sparta Praha var knepen favoritt over Universitet Vitebsk og innfridde. Den største positive og negeative overraskelsen var nok det rumenske laget CFF Clujana, som greide uavgjort mot favorittene, men ikke lyktes i å slå bunnlaget fra Litauen, og endte dermed poenget bak andreplassen.
KS AZS Wroclaw og FC Arsenal Kharkiv hadde møttes tidligere (da med Arsenal Kharkiv som Metalist Kharkiv), og Wroclaw vant greit. Den eneste forskjellen denne gang var at Wroclaw vant enda mer overlegent, mens Kharkiv var flinkere til å score mål mot dårligere motstand, særlig 20-0-seieren mot AEK Kokkinochovion fra Kypros, som knapt hadde et landslag, skilte seg ut.
Alma KTZH og AE Aegina hadde begge vunnet sine kvalifiseringsgrupper året før, og var favoritter. Aegina vant det innbyrdes oppgjøret favorittene imellom, men Alma gikk videre etter at Aegina rotet bort poeng mot de andre lagene.